Ngay sau khi đội tuyển U20 Indonesia kết thúc hành trình vòng bảng giải U20 châu Á 2025, HLV Indra Sjafri đã tuyên bố sẵn sàng rút lui.
Đội tuyển U20 Indonesia đặt mục tiêu lọt vào vòng chung kết World Cup U20 năm 2025 tại Chile. Tuy nhiên, đội bóng trẻ xứ sở vạn đảo bị loại ngay sau vòng bảng, với kết quả một trận hòa và hai trận thua, chỉ được một điểm, xếp thứ 3, sau Iran và Uzbekistan, trên Yemen. Sau khi U20 Indonesia bị loại sớm, HLV Indra Sjafri nói rằng, ông đã không hoàn thành mục tiêu đưa đội tuyển U20 Indonesia vào VCK World Cup U20 và sẵn sàng chịu trách nhiệm.
Trước khi giải U20 châu Á 2025 diễn ra, HLV Indra Sjafri được đánh giá là ứng cử viên nặng ký cho vị trí HLV trưởng đội U22 xứ sở vạn đảo, tham dự SEA Games 33 vào cuối năm. Mặc dù vậy, cho đến thời điểm hiện tại, có thể ông Sjafri đã mất luôn cơ hội dự SEA Games 33.
Tại SEA Games 32 năm 2023 trên đất Campuchia, HLV Indra Sjafri chính là người giúp đội tuyển U23 Indonesia vô địch nội dung bóng đá nam đại hội thể thao Đông Nam Á, sau 32 năm chờ đợi.